MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 7491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013205	CT	3	6	136636	136641	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
502	NC_013205	CCT	2	6	136894	136899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_013205	GCG	2	6	136957	136962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_013205	GGTG	2	8	139220	139227	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
505	NC_013205	GC	3	6	141520	141525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
506	NC_013205	T	6	6	141548	141553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_013205	GCA	2	6	141562	141567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_013205	GGA	2	6	141569	141574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_013205	CGA	2	6	142459	142464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_013205	GAAAC	2	10	142465	142474	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
511	NC_013205	CGA	2	6	142518	142523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_013205	CGC	2	6	142854	142859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_013205	TCG	2	6	142861	142866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_013205	A	6	6	142971	142976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_013205	GAT	2	6	142983	142988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_013205	A	6	6	143005	143010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_013205	T	7	7	143011	143017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_013205	GC	3	6	143020	143025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
519	NC_013205	GCG	2	6	143045	143050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_013205	CAT	2	6	143069	143074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_013205	GTTC	2	8	143075	143082	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
522	NC_013205	GAAG	2	8	143107	143114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_013205	TCG	2	6	143200	143205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_013205	CG	3	6	143302	143307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
525	NC_013205	GGT	2	6	143314	143319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_013205	T	7	7	143355	143361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_013205	CG	3	6	143368	143373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
528	NC_013205	GCG	2	6	143379	143384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_013205	CG	3	6	143387	143392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
530	NC_013205	AAC	2	6	147676	147681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_013205	ACA	2	6	147686	147691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_013205	TGG	2	6	147706	147711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_013205	TGG	2	6	149008	149013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_013205	CTC	2	6	150880	150885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_013205	G	6	6	150962	150967	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
536	NC_013205	CGC	2	6	150974	150979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_013205	CGAG	2	8	151034	151041	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
538	NC_013205	AGG	2	6	152334	152339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_013205	CGCC	2	8	152983	152990	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
540	NC_013205	CAATC	2	10	152997	153006	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
541	NC_013205	CAGGGG	2	12	153007	153018	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
542	NC_013205	G	6	6	153015	153020	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
543	NC_013205	TCGC	2	8	154009	154016	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
544	NC_013205	TCC	2	6	154043	154048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_013205	CG	3	6	154097	154102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
546	NC_013205	GA	3	6	154158	154163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
547	NC_013205	ATC	2	6	154198	154203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_013205	GCC	2	6	154234	154239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_013205	GCCGCG	2	12	155813	155824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
550	NC_013205	ACG	2	6	155836	155841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_013205	TA	3	6	155938	155943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_013205	CATC	2	8	157619	157626	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
553	NC_013205	AGG	2	6	157636	157641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_013205	GC	3	6	158021	158026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
555	NC_013205	GGA	2	6	158040	158045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_013205	CCG	2	6	158067	158072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_013205	AGG	2	6	159634	159639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_013205	G	6	6	162803	162808	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
559	NC_013205	AGG	2	6	163688	163693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_013205	GC	4	8	164906	164913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
561	NC_013205	GAAGG	2	10	164970	164979	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
562	NC_013205	GGTC	2	8	164999	165006	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
563	NC_013205	CGC	2	6	165063	165068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_013205	GAC	2	6	165069	165074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_013205	G	6	6	165096	165101	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
566	NC_013205	TCG	2	6	165175	165180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_013205	CGGG	2	8	165197	165204	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
568	NC_013205	CGG	2	6	165255	165260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_013205	GGC	2	6	165267	165272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_013205	GCG	2	6	165281	165286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_013205	GGA	2	6	166498	166503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_013205	CTG	2	6	166504	166509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_013205	CT	3	6	166532	166537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_013205	CGG	3	9	166569	166577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_013205	CCG	2	6	166580	166585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_013205	C	6	6	167264	167269	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
577	NC_013205	G	8	8	167277	167284	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
578	NC_013205	AAGA	2	8	167344	167351	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
579	NC_013205	CGG	3	9	169136	169144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_013205	GGT	2	6	171189	171194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_013205	T	6	6	172440	172445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_013205	TTC	2	6	172506	172511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_013205	TAT	2	6	172533	172538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_013205	GCCA	2	8	172553	172560	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
585	NC_013205	GGC	2	6	174111	174116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_013205	A	6	6	175473	175478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_013205	TCGA	2	8	175492	175499	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
588	NC_013205	ATC	2	6	175523	175528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_013205	CGA	2	6	175593	175598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_013205	CGG	2	6	175607	175612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_013205	AG	3	6	175621	175626	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
592	NC_013205	CGGG	2	8	176419	176426	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
593	NC_013205	GAG	2	6	176454	176459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
594	NC_013205	GA	3	6	177263	177268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
595	NC_013205	GGA	2	6	180190	180195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_013205	CAT	2	6	181950	181955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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598	NC_013205	TGAT	2	8	182009	182016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
599	NC_013205	AAGG	2	8	182062	182069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_013205	CG	3	6	182154	182159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
601	NC_013205	CT	3	6	182212	182217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
602	NC_013205	TGAAC	2	10	182249	182258	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
603	NC_013205	AG	3	6	182259	182264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_013205	GGCCG	2	10	182272	182281	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
605	NC_013205	TG	3	6	183425	183430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
606	NC_013205	TAT	2	6	183461	183466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_013205	GAT	2	6	184167	184172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_013205	TCC	2	6	185503	185508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_013205	AAGCG	2	10	187992	188001	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
610	NC_013205	GC	3	6	188127	188132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
611	NC_013205	ATC	2	6	188258	188263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_013205	CG	3	6	188286	188291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
613	NC_013205	GGT	2	6	188316	188321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_013205	CTTGC	2	10	188682	188691	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
615	NC_013205	T	6	6	188694	188699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_013205	CCG	2	6	188720	188725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_013205	AGGG	2	8	188783	188790	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
618	NC_013205	TGGCA	2	10	188794	188803	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
619	NC_013205	CGG	2	6	188804	188809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_013205	GGC	2	6	188989	188994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_013205	ATC	2	6	188999	189004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_013205	GCC	2	6	189008	189013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_013205	TTG	2	6	189016	189021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_013205	CAT	2	6	189029	189034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_013205	GAT	2	6	189062	189067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_013205	CGC	2	6	192589	192594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_013205	CTAGTC	2	12	192604	192615	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_013205	A	6	6	194776	194781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_013205	TGA	2	6	194782	194787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_013205	GCC	2	6	194806	194811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_013205	GTG	2	6	194875	194880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
632	NC_013205	TG	3	6	195191	195196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
633	NC_013205	T	6	6	195222	195227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_013205	C	7	7	195258	195264	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
635	NC_013205	CA	3	6	195303	195308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
636	NC_013205	GC	3	6	195311	195316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
637	NC_013205	GGA	2	6	195319	195324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
638	NC_013205	GCC	2	6	198269	198274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_013205	GCG	2	6	198279	198284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_013205	AC	3	6	198334	198339	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
641	NC_013205	ATA	2	6	202248	202253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_013205	TGAGGG	2	12	202287	202298	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
643	NC_013205	CGGA	2	8	202900	202907	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
644	NC_013205	CGA	2	6	202934	202939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_013205	G	6	6	202988	202993	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
646	NC_013205	TG	3	6	203000	203005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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649	NC_013205	CGCA	2	8	203094	203101	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
650	NC_013205	GGC	2	6	203107	203112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
651	NC_013205	GCGGT	2	10	203119	203128	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
652	NC_013205	GGAGGC	2	12	203134	203145	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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655	NC_013205	GC	3	6	205597	205602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
656	NC_013205	GGA	2	6	206571	206576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
657	NC_013205	GCC	2	6	206997	207002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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659	NC_013205	GCG	2	6	207517	207522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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662	NC_013205	CGC	2	6	207849	207854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
663	NC_013205	CGG	2	6	207876	207881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
664	NC_013205	TGTA	2	8	208061	208068	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
665	NC_013205	CGG	2	6	208076	208081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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668	NC_013205	GGC	2	6	212989	212994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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672	NC_013205	CG	3	6	215100	215105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
673	NC_013205	GGCG	2	8	215113	215120	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
674	NC_013205	TCTT	2	8	215121	215128	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
675	NC_013205	GAG	2	6	215177	215182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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679	NC_013205	GCG	2	6	217105	217110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
680	NC_013205	TCG	2	6	217124	217129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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772	NC_013205	AGG	2	6	229463	229468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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774	NC_013205	CGG	2	6	229513	229518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
775	NC_013205	GA	3	6	229611	229616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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778	NC_013205	GTT	2	6	229801	229806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
779	NC_013205	CCT	2	6	229872	229877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
780	NC_013205	CG	3	6	229925	229930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
781	NC_013205	GGT	2	6	230008	230013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
782	NC_013205	CGT	2	6	230203	230208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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784	NC_013205	GAAG	2	8	230409	230416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
785	NC_013205	GAC	2	6	230431	230436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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787	NC_013205	GCGA	2	8	230567	230574	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
788	NC_013205	GAGC	2	8	230679	230686	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
789	NC_013205	AGCC	2	8	230696	230703	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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791	NC_013205	CCT	2	6	230790	230795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
792	NC_013205	AGGT	2	8	230800	230807	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
793	NC_013205	GA	3	6	230819	230824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
794	NC_013205	GCC	2	6	230863	230868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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798	NC_013205	CTC	2	6	230938	230943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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802	NC_013205	AGA	2	6	231208	231213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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806	NC_013205	GC	3	6	232739	232744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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811	NC_013205	CG	3	6	234075	234080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
812	NC_013205	TTTTC	2	10	234101	234110	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
813	NC_013205	CCG	2	6	235213	235218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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824	NC_013205	GC	3	6	239719	239724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
825	NC_013205	AGG	2	6	239772	239777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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830	NC_013205	GAG	2	6	247177	247182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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842	NC_013205	TCG	2	6	255938	255943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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844	NC_013205	GAG	2	6	258971	258976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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852	NC_013205	GAG	2	6	260153	260158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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871	NC_013205	GC	4	8	266836	266843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
872	NC_013205	ATC	2	6	268563	268568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
873	NC_013205	TCG	2	6	268570	268575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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875	NC_013205	CG	3	6	268677	268682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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878	NC_013205	CCG	2	6	268709	268714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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882	NC_013205	TCC	2	6	268875	268880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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884	NC_013205	GACA	2	8	268916	268923	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
885	NC_013205	AGGG	2	8	268925	268932	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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902	NC_013205	G	6	6	273461	273466	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
903	NC_013205	CGGG	2	8	273569	273576	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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909	NC_013205	CG	3	6	281003	281008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
910	NC_013205	GCCCA	2	10	283363	283372	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
911	NC_013205	CCAT	2	8	283409	283416	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
912	NC_013205	GAG	2	6	283417	283422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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914	NC_013205	GAAA	2	8	284737	284744	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
915	NC_013205	GTT	2	6	284762	284767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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